书接上文，几天后，查阜西见海军部迟迟不作答复，便求见于海军总司令蓝建枢，希望他将学生的要求转达给民国政府。蓝建枢根据学潮的情形，呈请海军部核办。海军总长（部长）萨镇冰立即电复蓝建枢，让他在上海就近劝慰学生，静待解决，并未作出实质性的决定。
      也就在这几天，广东黄埔海军学校的学生得知烟台海军学校学生罢课的消息后，发电报给查阜西等，询问详情。立即作出决定，表示声援，全体学生打点行装，准备北上上海。校长邓骢保闻讯，大惊失色，遂百般劝导，答应代表学生意愿，向上为烟台学生辩解，这才才将学生稳住。但学生还是通电全国各媒体及要人，电报说:“我国海军之腐败，实由于军阀之自私，他们以海部为私产，余则皆以粉饰为完备。须知有实心然后有实政，若乃虚文是尚，事实全无，海军振兴必成绝望。诸君能奋勇力争以警其迷，万乞贯彻初衷，粤校学生必不漠视于南”。并遣派南京籍学生田乃宣赴南京请愿，田乃宣到南京后，应邀参加了南京学生联合会元旦晚会，借此机会，他报告了烟台海军学校学生离校原因及要求，学生联合会当即作出援助的决定：“代电海军、教育两部及徐世昌大总统、国务院力争；若田乃宣在宁请求江苏督军、省长不生效力时，学生会则召集各校代表至军、民两署代为请愿，务求达到目的；令全国学生联合会之南京理事在沪提议援助海军学生，务使其能得到圆满效果”。 次日，江苏督军李纯则亲自接见了田乃宣，对罢课学生的举动表示同情，并表示一定代为力争。立即和江苏省长齐耀琳联名致函海军总长萨镇冰，请其速速处理烟台海军学校失学学生问题，以免他们继续流离上海，辍学无归。同时，广州军政府政务院秘书厅厅长章士钊致电总裁岑春煊、林葆怿，表示同情烟台海军学校学生，认为他们的举动虽有些过激，但主张尚属正常，北京政府海军部应予采纳，并劝令学生回校，以免荒废学业。军政府参事会参议彭允彝则致电湖南督军谭延闿，希望顾念烟台海军学校湘籍学生也因反对海军腐败来沪奔走，速向北京政府为学生力争。
      一时间，查阜西等罢课学生成为各界关注的焦点。海军部派出军事科科长王传炯和烟台海军学校学监许秉贤赶往上海。到上海后，王传炯对待学生的态度十分强硬，同时还利用私人、皖籍等名义拉拢学生，引起学生的强烈反感。特别是查阜西从北京海军部方面获得消息，说学生所提条件由3条增加到了5条，内容是：“一、以后海军学校招生须通知各省；二、增加学生月薪，放暑假；三、吴淞海校图书仪器酌量移入烟校；四、取消操行密记；五、准学生自由通函省长。”查阜西等认为，这5条要求是王传炯有意捏造，目的是混淆视听，这不仅违背了他们离校的初衷，而且还有辱没了他们的人格，见面会不欢而散。因此，谈判随即宣告破裂。
        1920年1月底，在北洋总理靳云鹏直接干预下，北京政府海军部对烟台海军学校的主管人员进行了严厉的申斥，并作出决定，对该校部分官员进行调整，校长曾瑞祺调往海军部任参议，副官赵士淦、正教官郑衡等调往上海海军总司令部，原薪差遣。同时，将查阜西、高翔鹄、黄秉衡、聂开一、谢世亿、郑公德、郭德权、朱凤藻等11名带头罢课的学生开除学籍，同时按原计划将吴淞海军学校并入烟台海军学校，也就是说第十六届学生返校后，按新学制将继续在校学习两年。
      1920年2月1日，查阜西联名被开除的十名学生及十几位仗义留下来的学生（林琪、汪炯、王之烈、徐锡鬯、熊墨林、高翔鹄、郑公德、翟骥身、王作民、杨锡茂、王立勋、聂开一、郭德权、王启刚、孟宪凭、李锡祉、马崇贤、廖新鼎、卫启贤、朱凤藻、谢世亿、周燮欧、黄秉衡、齐镇午）在《时事日报》上刊发《留沪烟台海军学生再告国人书》:留沪烟台海军学生，谨再泣告于国中父老兄弟诸姑姊妹之前。曰:“同人等以八十一人出校来沪，一再宣言，力争三事。举凡含哀请愿之呈文，冒死陈情之代表，无不应具尽具。而彼海军部始终一语之慰藉，无一款之容纳。始则以加薪放假相诱导，继则以革除少数相威协，今于无可如何之时，竟敢暮夜苞苴公行，暗中贿赂运动中不肖份子，惑之于歌舞色妓之场，醉之于酒肉呼垆之地，以致因此堕落而返校者有十余人。又复致函学生家属，恫吓协制，利用家属以迫协学生，因此牵制而返校者又有二十余人。再以同人因奔走致病，请假归里者，又有十余人。以至在沪宣誓决不返校者,仅存二十五人。又复力竭声嘶,饥寒交窘。呜呼！此何时乎？非同人等之末日乎？同人等固手无寸铁之学生也，徒以良心不可死，公理不可亡，腐败欺骗之教育不可不推翻，公平正当之章程不可不恢復，故有此一举耳。今彼必以老敌离间之种种诡计，所以困寇雠者难以困学学，则同人等之必至路末途穷，彼固早操万全之胜算。呜呼！彼能辱没青年之良心，实行自乐之政策，其忍尚可问，其毒尚可言乎?青岛、福州之交涉，不闻后盾，而以狮搏兔之威力，已及学生，可怜膏脂豢此无用之材。徒愤危亡，空悲壮士之志;魯难未已，惟抉眸看越寂之飞来。力弱援穷，宁延颈待奸人之斧钺耳？彼谓金钱之魔力万能，我谓青年之格神圣也。此身一日尚存，奋斗之雄心不死！寄语若辈特殊势力家，勿谓人尽可欺，理皆可灭！须知田横五百壮志可追，苟不自觉悟，五步之内当以颈血溅汝也。此次团体涣散，原知造成青年界莫大之罪恶，灰尽全国人莫大之希望，咎能可辞，罪毋庸诿。惟望舆论痛加指责，于此次改革奋斗，留一莫大之纪念。则此二十余人虽牺牲一己，亦所愿也！”
       文章登出后，查阜西一行人的遭遇再次引起社会各界人民的强烈反响。缘于当时，以五四运动为开端在全国范围内的学生罢课运动已渐渐平息，各地学生己经陆续复课，查阜西他们也就独木难支，学潮逐渐平息。
        万幸的是，学潮期间，查阜西在叶楚伧的介绍下结识孙中山，数次会唔，得到了他的赏识。在去北京大学汇报学潮情况时，认识了李大钊、蔡元培、陈独秀、胡适、易卜生、荆嗣佑等社会名流，并成功考入北京大学，虽然缘于聂开一的函电交驰而放弃就读机会，一同追随孙中山南下广州，峥嵘岁月，暂告平静。在1921年春，进入广东航空学校学习，途中，查阜西作诗:《去羊城》:红桃绿柳垂檐间，抱得秦筝不忍弹。回首可怜歌舞地，东风无力百花残。